درک فرایند های انکوژنیک با فناوری های پروتئومیکس

‍#Neuro_AI

📱عنوان مقاله: درک فرایند های انکوژنیک با فناوری های پروتئومیکس

🔰تجزیه و تحلیل ترانسکریپتومیک و پروتئومیک نقشی ضروری برای درک مکانیسم های نظارتی بر بیولوژی سرطان ایفا می کند. از آنجایی که سطح mRNA اغلب با سطح پروتئین ارتباط متوسطی دارد، برای به دست آوردن تصویر کاملی از بیان ژن در بیولوژی سرطان، به رونوشت و پروتئوم نیاز داریم.

ابزارهای پیشرفته بیوانفورماتیک عمق پروفایل پروتئومی را برای مطالعات سرطان به میزان زیادی بهبود می‌بخشند و تشخیص تقریباً همه پروتئین‌های بیان‌شده را تسهیل می‌کنند. چنین پوشش بالایی امکان تجزیه و تحلیل سیستماتیک پروتئین های با فراوانی کم از جمله کیناز ها را فراهم می کند.

از طرفی، تجزیه و تحلیل جامع فسفوپروتئوم اطلاعات تکمیلی در مورد pathway/network activities ارائه می دهد، این در حالی است که بسیاری از اجزای مسیرها در سطح پروتئین تغییر نمی کنند، اما از نظر فسفوریلاسیون در طول انتقال سیگنال تغییر می کنند.

🔰به این ترتیب، فناوری‌های omics درک مکانیکی پیشرفته‌تری از فرآیند انکوژنیک ارائه می‌کنند و آسیب‌پذیری‌های درمانی بالقوه را آشکار می‌کنند.

🔰 تلاش های اولیه برای درک خصوصیات پروتئومی شبکه های مولکولی از طریق رویکردهای مبتنی بر آنتی بادی بود. با این حال، این رویکردهای هدفمند با وسعت و عمق پروفایل، عمدتاً به دلیل در دسترس بودن و ویژگی آنتی‌بادی، محدود می‌شدند. اکنون می‌توان رونوشت، پروتئوم عمیق و فسفو پروتئوم را برای مطالعه شبکه‌های سیگنالینگ انکوژنیک ادغام کرد. این روش درک بیولوژی سرطان را بهبود می بخشد.

🔰 به عنوان مثال: گلیوماهای درجه بالا (HGG) شایع ترین تومورهای بدخیم مغزی هستند و مرگ و میر زیادی را به همراه دارند. اکثر مسیرهای سیگنال دهی سرطانی دز HGG فقط در فسفو پروتئوم تغییر می‌کنند در حالی که کل پروتئوم تغییر نمی‌کند.

این موضوع، نقش ضروری پروفایل فسفوپروتئومی برای رمزگشایی سیگنال‌های انکوژنیک را تأکید می‌کند.

گرد آورنده: دکتر آیلین سرانجام

ادیت: خانم دکتر الناز امانزاده

🆔@Neurosurgery_association